Al mismo tiempo, la Policía de Seguridad Aeroportuaria se mantiene en alerta, principalmente, en el Aeropuerto Internacional Ministro Pistarini, ubicado en el partido de Ezeiza, para vuelos internacionales, y en el Aeroparque Jorge Newbery porteño, para conexiones regionales.

En cuanto a Prefectura Naval, aporta patrullajes en cursos de agua como el Río Bermejo, que une el extremo norte de Argentina y el extremo sur de Bolivia; y puntos sensibles del río Paraná, que recorre las provincias de Misiones, Entre Ríos, Corrientes, Santa Fe, Chaco y Buenos Aires, y que alberga las centrales hidroeléctricas de Itaipú y Yacyretá.